左宗棠因祸得福,反而以四品京堂发交曾国藩差遣,并从此飞黄腾达。肃顺在无饷可拨、无兵可战的绝境逼迫下,及时进言,要求任命曾国藩为两江总督。咸丰帝也一反以前所为,转而采取倚重曾国藩湘军集团的姿态。8月10日,清廷又“实授曾国藩为两江总督,并命为钦差大臣,督办江南军务”,“大江南北诸军,均归节制”。
辛酉政变后,新掌权的慈禧太后和恭亲王奕等人,采取所谓“中外同心以灭贼为志”,也即中央朝廷与地方督抚协力同心镇压太平天国的方针,从而更加倚重曾国藩及其湘军集团。1861年11月20日,也即同治帝载淳正式即位的第十天,清廷宣布由钦差大臣、两江总督曾国藩“统辖江苏、安徽、江西三省并浙江全省军务。所有四省巡抚提督以下各官,悉归节制”。已升任太常寺卿的左宗棠也被委以浙江军务的重任,“浙省提镇以下各官,均归左宗棠调遣”。面对骤然涌至的大权,曾国藩亦不禁心绪复杂地感慨道:“昔太无权,今太有权,天下事难得恰如题分也!”