袁世凯得知这个消息后,非常震惊,连忙去见杉村,要求解释,而对方再次向他保证:“日本别无他图。”尽管如此,中日两国军队在朝鲜的存在,导致紧张局势突起,俄国和法国的公使馆于6月10日开始撤离其工作人员。
这时候,朝鲜国内形势发生了戏剧性的变化。东学党听说中日两国军队开到,纷纷自动解散,其首领崔济愚等人也化整为零,潜入地下。6月11日,朝鲜政府和造反者达成了全州和议,清军实际上没有投入平乱之战。
6月12日,日本公使大鸟率领一千名日本官兵返回汉城,告诉袁世凯:叛乱一经镇压,和平与秩序一经恢复,日本会立即撤兵。他接着通知袁世凯:日本有意参与平叛的作战。
李鸿章无意于发动对日战争,但他根据种种迹象分析,意识到情况已是危如累卵,于是命令部队停止于平壤以南的光州。而袁世凯则与大鸟达成了口头协议:两国都不得向朝鲜增兵。然而事实上,日军不撤反增。朝鲜政府面对着将要爆炸的局面,反过来请求李总督撤兵,其理由是东学党听说“天兵”来剿,闻风丧胆,动乱已平。
不仅是朝鲜人请求清朝撤兵,清军总兵聂士成也动了心机,向李鸿章建议迅速撤兵,他的想法是要使日本在朝军队陷于孤立。他认为,清军一撤,在国际舆论压力下,日本也会自动撤军。但李鸿章迟疑不决,要求日本先撤兵,而日本人只是口头敷衍。他们用尽心机欺骗忽悠,从李鸿章手中偷走了主动权,驻朝日军从6月12日的一千人增加到一周后的三千人。6月21日,日军又增至一万五千人。他们精心挑选驻兵地点,占据了仁川、釜山与汉城这些有利位置,人数上以二比一超过了清军。清军现在发现自己处境极为尴尬。他们本来是要到朝鲜南部镇压叛乱的,但如今无法抵达指定地点,因为日军颇有预见性地沿三八线部署,挡住了清军的道路。而清军若在这个阶段撤退,便意味着将中国的宗主权拱手让给了日本。李鸿章左右为难,不知所措。然而,有一件事在他脑子里是很清晰的:他必须不惜一切代价避免与日本开战。