1932年下半年,佐尔格被召回莫斯科,提前结束了他的中国之行。按佐尔格的说法:“如果不是为了崇高的事业,我将在中国一直待下去,我已深深地迷恋上这个国家了。”
“九一八”事变后,苏联决定在日本组建情报网。1933年,佐尔格被派到了日本。到了日本不久,他就成立了一个潜伏在日本的苏联谍报组织“拉姆赛”小组,搜集关于日本陆军体制、领导人、内部派系等多方面的情报。他与德国驻东京的奥特大使是好朋友。因为他的全力协助,奥特官运亨通。奥特难以抵挡佐尔格博士的友谊,他把使馆的军事密码都告诉了他。所以佐尔格可以公开在大使馆办公,有机会一连几小时地研究第三帝国的绝密材料,有时干脆把材料带回自己办公室拍照或收藏在自己的保险箱里。佐尔格说:“我的第一件事是把来电分门别类地加以整理。挑选较重要的新闻给使馆高级人员过目;然后着手编新闻摘要,发给侨居日本的德国人。”此外,他还编新闻通报,分发给日本的报刊。
1937年,日军攻占南京后,佐尔格曾短暂回到中国,亲眼见证南京大屠杀,将拍摄下来的一幅幅骇人照片寄回德国。
1938年,根据他的情报,莫斯科知道关东军正在积极准备向苏联发动武装入侵,提前加强了战备。哈勒欣河之战前夕,关于关东军部署、武器装备、战争物资的运输等详细情报,又被及时送到了莫斯科。开战后,苏军获胜。日本被迫与蒙古人民共和国签订停战协定。