喀布尔周围已被政变部队所控制，达乌德只有命令距喀布尔800公里外仍忠诚于他的空军前来支援。由于路程远，往返的耗油量大，战斗轰炸机只能在喀布尔上空停留十多分钟，又因未能与地面取得无线电联系，未掷一弹而返。因为无线电联络设备已被克格勃暗中破坏。下午3时后，支持政变的一支空军的米格战斗轰炸机从临近机场起飞，向总统府俯冲。总统府的高射炮因事先被损坏而失灵，只有听任飞机轰炸。密集的炸弹摧毁了抵抗的据点。晚上，政变部队攻占了总统府，达乌德等人被俘。
政变领导人对失败者采取了消灭肉体的血腥手段。据透露，被俘的达乌德总统和他的弟弟穆罕默德·纳伊姆拒绝投降，政变部队当着他们的面枪杀其亲属，达乌德的3个儿子和儿媳、孙子和孙女被杀后，再枪杀其本人。达乌德一家30余口，除一孙女幸免遇难外，全部被屠杀。
政变得手后，政变领导人仍命令大批屠杀被俘或投降的前总统府卫队、警察部队和其他治安部队人员。据估计，在这次政变中，死亡的人数达一二千人。随着喀布尔总统府的陷落，阿富汗各地的驻军相继宣布效忠新政权，但仍有一部分忠于达乌德的部队拒绝效忠，出现了局部的战斗。