药仙的宗门有一敌对势力，极其强大，多次发生战斗，药仙的宗门死伤惨重，看到这种情况，药仙投入丹道，研制出很多救命良药，让药仙的宗门死伤大为减少。
药仙一天天长大，修为越来越高，在炼丹上达到了极高的造诣，这时候师父求他炼制毒丹，灭掉对方宗门，药仙不肯，自己所炼丹药只为救人，不为杀人，看药仙态度坚决，师父只得作罢。
随着时间的推移，药仙和师妹喜结连理，两人很恩爱，像一对神仙眷侣般惹人羡慕，可是好景不长，敌对势力趁他不在，杀了他的妻子，药仙大怒，誓要灭掉对手为妻子报仇。
从此药仙开始研制毒丹，怎么狠毒怎么来，一枚丹药可将一处城池化作死地，此时的药仙已不在是药仙，成为了毒仙。
在他的帮助下，敌对势力无论大小老少全被灭了个干净，师父很开心，要将他立为宗门接班人。
可是药仙报仇以后再也没有丝毫兴趣，他的余生只剩两个目标，复活妻子和探寻自己的身世，他拒绝了师父的好意。
一边修行，一边寻找正本溯源之法，这是仙人法术，能够将当年的情况还原回来，终于许多年过去以后，药仙修炼到真仙境，成为了名副其实的药仙，而他也终于学会了正本溯源之法。
经过多方打听，寻找到了自己出生的地方，离敌对势力很近，只是此时已无敌对势力，全在药仙宗门控制之下。