但临阵易帅并不容易，加上彼时的皖系中确实也再没有几个能征善战的将领，靳云鹏称病，傅良佐兵败，倪嗣冲也不是善战之将，至于段芝贵、卢永祥、田中玉、吴光新等既难以服众也不是统兵的上佳人选，加上当时国会选举迫在眉睫，徐树铮不能前去，段祺瑞一时也想不出更好的人选。段祺瑞终归是“过来人”，自然明白张怀芝的心思，于是以国务院名义向张怀芝保证“鲁督决不易人”，并且保证会继续向南征第二路军运送枪械和兵员，力劝张怀芝立即由汉口前往江西主持军事。
段祺瑞认定时值大破南军、统一西南的大好时机，而曹锟和张怀芝停滞不前让他大为光火，急忙派徐树铮南下主持对南军事。徐树铮当时在北京和汉口两处不停奔波，既忙着策划国会选举，这边的两位统帅也不听调度，他只好依靠奉军继续南征，于是停止援川的计划，将奉军急调湖南，并且在汉口设立奉军前敌总指挥部。9日，派奉军第二十七师师长孙烈臣、第二十八师师长汲金纯、第二十九师师长吴俊升到长沙，并布置奉军入湘作战的计划。
在广州失利后逃到北京的龙济光，在北军南征的局势进展得较为顺利时，开始大肆鼓吹征粤。龙济光本来是广东督军，给李烈钧打得丢盔卸甲，如今只剩下了自己一个光杆司令，逃到北京以后眼见自己已经没有利用价值，自然是心有不甘，于是希望能够得到重整旗鼓的机会，再杀回广东。其时段祺瑞早就已经安排福建督军李厚基联合浙军进攻潮梅，但却遭到粤军陈炯明部的反击。17日，陈炯明率部占领武平和永定县芦下坝，后于20日占领上杭县峰市镇，李厚基作战不利只好节节败退。