占据荆州的桓玄，攻灭殷仲堪、杨佺期，统一南京的上游，乘朝廷专力对付孙恩，大举入寇，攻破京城，流窜道子，杀元显及晋宗室，废司马德宗，晋朝臣全部归降，玄自立为楚皇帝。
晋大将刘牢之先降桓玄，被玄逼死。刘裕起兵攻杀桓玄，尽灭桓氏族，复司马德宗帝位，政权全归刘裕。后十五年，刘裕篡晋，东晋亡。
东晋十一帝，首尾一百零四年。
（二）宋朝（四二〇年—四七八年）
刘裕的事业——刘裕是破落的低级士族，也是被乡里贱视的无赖穷子，侨居京口，家贫不能读书，曾做农夫、樵夫、渔夫及卖履小贩，酷爱赌博，曾因欠大族刁逵赌债三万钱，被逵缚马桩上索债。裕富贵后，灭刁氏族，令贫民分刁氏财物，整天取不尽。孙恩乱起，裕在刘牢之军中当小军职，勇健有胆气，屡立战功。当时诸将专掠民财，比孙恩尤残暴，裕独申明纪律，不甚扰民。桓玄篡晋，裕在京口聚众百余人，攻入京城，桓玄逃归荆州，裕杀玄，恢复晋朝。