1945年3月，谢伟思再次从重庆来到延安，毛泽东把他当作老朋友，和他进行了一次亲切友好的会谈。
这时与1944年相比，国共两党之间的矛盾更加激烈了。毛泽东强烈地要求蒋介石政府承认中共的合法地位，承认共产党领导下的军队是国家军队的一部分，承认解放区是合法的地方政府。毛泽东还要求蒋介石政府立即召开多党派会议，着手组建联合政府。
毛泽东说这话的意思，显然是希望谢伟思能回去转告蒋介石政府和美国政府。但是谢伟思这时已是不受赫尔利和蒋介石欢迎的人物了。他回到重庆没多久，便被赫尔利打发回了美国。而且祸不单行，两个月之后，由于涉嫌“《美亚》间谍案”，他遭到了逮捕。
当消息披露之后，美国右翼报纸立即喧闹起来，说“被窃文件……促使美国转向亲毛反蒋，而偷文件的主角则是谢伟思，他与毛泽东及其领导下的共产党关系密切。”国民党的报纸更展开想象的翅膀，称谢伟思是个日本间谍。
司法部在8月份把这一案件交给由20人组成的大陪审团审理。由于证据不足，表决的结果是：14票同意对贾菲和拉森提出起诉，13票同意对罗思起诉，同意对迈克尔起诉的只有2票，同意起诉盖恩的只有5票。而在讨论谢伟思时，表决的结果是20对0，拒绝起诉。