国民党对社会团体的严密控制虽然极大地压制了社会各界在政治上的伸展，但大批社会团体的存在和国民党出于控制社会的目的所给予的扶持，也仍旧会提升市民的自治意识和组织能力，从而造成社会民众参政意识的增强。绝大多数社会团体，即使惧于政府与党部的高压，始终保持与政府合作，比如努力协助政府调处行业中各种纠纷，减轻政府压力，并向政府提供各种有关推进发展工商业、整顿市场、维持秩序的合理化建议等，但它们也还是在不同程度上具有其独立性，因而在与政府和党部的关系上，还是会存在诸多的矛盾，比如代表行业就不合理的收费、压迫以及规定，向政府进行抗争等。1933年发生在南京的社团与政府之间的对抗，就比较典型地反映出社会团体与政府之间关系的复杂情形。当时，小黄洲（今安徽滁州）农民赴南京请愿，要求政府补助由于江潮泛滥、垦地冲毁所带来的损失。南京市政府警卫在农民静坐示威时殴伤农民4人，并拘押5人。请愿农民迅速找到南京市农会，要求援助。南京市农会当即召开紧急会议，请市党部主持公道。在市党部不能解决问题的情况下，南京各区农会代表遂直接向国民政府行政院请愿。南京各有关团体这时也纷纷声援小黄洲农民，甚至要求罢黜南京市市长石瑛。此事对南京市政府造成了极大的压力。